Centro Multiusuário Darcy Fontoura de Almeida

IBCCF | UFRJ

Centro Multiusuário
Darcy Fontoura de Almeida

IBCCF | UFRJ

Espectrômetro de massas modelo Autoflex Speed, da Bruker Daltonics:

Fonte ionizadora MALDI com analisador TOF-TOF. Medição de massa exata de compostos e biomoléculas; análise de produtos biotecnológicos; identificação de proteínas em mistura.

Espectrômetro de massas modelo Amazon SL, da Bruker Daltonics:

ELECTROSPRAY com analisador ION-TRAP modelo Amazon SL. Análise qualitativa e quantitativa de moléculas orgânicas. 

Fontes de ionização APPI e APCI estão disponíveis para este equipamento.

Espectrômetro de massas modelo Impact HD, da Bruker Daltonics:

ELECTROSPRAY com analisador Q-TOF modelo Impact HD. Medição de massa exata de compostos; análise de biomoléculas em geral; análise de produtos biotecnológicos; identificação de proteínas em mistura (análise proteômica).

Fontes de ionização APPI e APCI estão disponíveis para este equipamento.

Espectrômetro de massas modelo Solarix XR de 7 Tesla, da Bruker Daltonics:

Fonte ionizadora ELECTROSPRAY/MALDI com analisador FT-ICR de 7 Tesla. Medição de massa exata de compostos; determinação de fórmula química de compostos; análise de biomoléculas em geral; análise de produtos biotecnológicos; identificação de proteínas em mistura (análise proteômica); preparo e análise de cortes histológicos e superfície de materiais por MALDI-Imaging.

Fontes de ionização APPI e APCI estão disponíveis para este equipamento.

Fontes de ionização APPI e APCI disponíveis para os espectrômetro de massas modelo Solarix XR, Imapact HD (qTOF) e Ion-trap (Amazon)

Sistema de cromatografia modelo Nexera X2, da Shimadzu Corp.:

Separação de amostras complexas; quantificação.

Sistema de cromatografia modelo Prominence, da Shimadzu Corp.:

Separação de amostras complexas; quantificação.

Colunas cromatográficas de diferentes composições:

– Ascentis C18 – 150 x 1 mm, 3 um (Supelco)
– Discovery BIO WidePore C18 – 150 x 1 mm, 5 um (Supelco)
– ODS-Hypersil C18 – 150 x 2.1 mm, 3 um (Thermo)
– Acquity Peptide CSH C18, 150 x 1 mm, 1.7 um (Waters)
– BIOshell A400 Preotein C4 – 150 x 2.1 mm, 3.4 um (Supelco)
– SeQuant ZIC-pHILIC – 150 x 2.1 mm, 5 um (Merck)
– Atlantis Silica HILIC – 150 x 2.1 mm, 5 um (Waters)
– GlycanPac AXR-1 – 150 x 2.1 mm, 3 um (Thermo)
 

Robô para depósito de matriz para preparo de amostra para imageamento por espectrometria de massas.

Sistema de sublimação para depósito de matriz para preparo de amostra para imageamento por espectrometria de massas.

Criostato Leica CM 1860 UV para cortes em congelamento, da Leica Bisystems

Espectrometro Chirascan – CD (Dicroísmo Circular) Applied Photophysics

Este equipamento é adequado para o estudo de moléculas quirais de todos os tipos e tamanhos. Em biologia, suas aplicações mais comuns estão relacionadas ao estudo de proteínas, incluindo:

  • avaliação das estruturas secundárias e terciárias;
  • determinação da resposta a alterações de temperatura e ação de químicos;
  • estudo dos processos de enovelamento e desenovelamento proteico.

 

Para saber mais sobre o uso do Chirascan CD, clique aqui.

Espectrofotômetro de Fluorescência  – Cary Eclipse/Varian

Este equipamento permite a análise de espectros de emissão e excitação de compostos orgânicos, inorgânicos e de macromoléculas, na região do ultravioleta e visível (200 a 800nm). Suas aplicações incluem:

  • determinação do perfil de emissão e excitação;
  • estudos de cinética;
  • construção de curvas de calibração para análises quantitativas;
  • determinação de tempo de vida de fluorescência

Ressonância Plasmônica de Superfície (SPR) – Biacore 3000 GE Healthacare Life Sciences

Este é um sistema de análise de interação de biomoléculas em tempo real que emprega a tecnologia de ressonância plasmônica de superfície (SPR). Com isso, é possível monitorar a formação e dissociação de complexos na superfície do sensor à medida que a interação ocorre. As medições são feitas sob condições de fluxo contínuo.

Ressonância Plasmônica de Superfície – SPR  Autolab Esprit

Este equipamento é usado para análise em tempo real de interações biomoleculares, tais como:

  • anticorpo-antígeno;
  • ligante-receptor;
  • proteína-ácidos nucleicos;
  • adesão celular.

As informações quantitativas obtidas podem ser usadas para cálculo de cinética de reação e da contante de afinidade, bem como para determinar a concentração ativa de biomoléculas em solução.

Shaker Innova 42 – New Brunswick Scientific

Este shaker incubador de órbita apresenta capacidade para frascos pequenos e de grandes volumes. Ele pode ser usados de forma contínua, cronometrada ou em várias etapas.

Incubator Shaker Series – Innova® 44, New Brunswick Scientific

Estes shakers incubadores de órbita apresentam capacidade para frascos pequenos e de grandes volumes. Eles podem ser usados de forma contínua, cronometrada ou em várias etapas.

Fast Prep MP. MP Biomedicals

Este homogeneizador de bancada de alta velocidade com capacidade para 24 tubos foi desenvolvido para a lise de amostras biológicas. O movimento empregado pelo aparelho aliado ao uso de beads apropriadas para a lise do material de interesse torna possível o rompimento de células resistentes para uso em diversas aplicações, incluindo:

  • isolamento de RNA;
  • obtenção de proteínas em sua forma ativa;
  • purificação de DNA genômico íntegro.
 

Para saber mais sobre o Fast-Prep 24, clique aqui.

Gel Doc XR System Bio-Rad

Este sistema de documentação de géis e blots permite capturar imagens em tempo real e conta iluminação integrada UV e por luz branca. Entre os corantes que podem ser usados para visualização no GelDoc XR destacam-se:

  • DNA/RNA: brometo de etídeo, SYBR green;
  • proteínas: Comassie blue, nitrato de prata;
  • blots: fluoresceína, reagentes colorimétricos.

O Gel Doc XR não é compatível com detecções quimioluminescentes (ECL, por exemplo).

Para saber mais sobre o GelDoc XR, clique aqui.

Ultracentrífuga TL-100 – Beckman-Coulter

Esta ultracentrífuga de bancada Beckman Coulter TL-100 foi desenvolvida para atingir velocidades até 100.000 rpm, equivalente a 540.000 g quando utilizada com o rotor TLA-100.3, disponível na PEPAB.

Ultracentrífuga Optima XL-100K – Beckman-Coulter

Esta ultracentrífuga Beckman Coulter Optima XL-100K foi desenvolvida para atingir velocidades até 100.000 rpm, equivalente a 802.000 g, quando utilizada com o rotor 100Ti. Classificada como “S”, ela pode ser utilizada com praticamente todos os rotores preparativos da Beckman (com exceção dos rotores Type 15). A PEPAB disponibiliza três rotores para esta centrífuga (SW 28 Ti, Type 70 Ti e Type 90 Ti), porém rotores de usuários podem ser levados para a Plataforma (consultar previamente).

Para saber mais sobre a Optima XL-100K, clique aqui.

 

Fermentador/Bioreator Bioflo 110 – New Brunswick Scientific

Este equipamento é um fermentador e biorreator modular desenvolvido para que os grupos de pesquisa possam obter maiores biomassas para seus experimentos.

Termociclador para PCR em tempo real – QuantStudio 3 – Applied Biosystems

Este espectrofotômetro tem capacidade de leitura e quantificação de diversas amostras (190-850 nm) e é capaz de realiza diferentes análises, tais como:

  • quantificação e determinação da pureza de ácidos nucleicos (260 nm);
  • quantificação de peptídeos (205 nm) e proteínas purificadas (280 nm);
  • ensaios colorimétricos de proteínas (BCA 562 nm, Bradford 595 nm, Modified Lowry 650 nm, Pierce 660 660 nm);
  • acompanhamento da densidade óptica de amostras.

 

Para saber mais sobre o uso do Nanodrop One, clique aqui

Espectrofotômetro Nanodrop One – Thermo Fisher Scientific

Este espectrofotômetro tem capacidade de leitura e quantificação de diversas amostras (190-850 nm) e é capaz de realiza diferentes análises, tais como:

  • quantificação e determinação da pureza de ácidos nucleicos (260 nm);
  • quantificação de peptídeos (205 nm) e proteínas purificadas (280 nm);
  • ensaios colorimétricos de proteínas (BCA 562 nm, Bradford 595 nm, Modified Lowry 650 nm, Pierce 660 660 nm);
  • acompanhamento da densidade óptica de amostras.

 

Para saber mais sobre o uso do Nanodrop One, clique aqui

Fluorímetro Qubit 3 – Invitrogen

Este equipamento é um fluorímetro de bancada que permite a quantificação de biomoléculas de forma sensível e precisa, uma vez que seu método de análise se baseia no uso de corantes fluorescentes específicos para cada tipo de molécula.

Os ensaios disponibilizados de fábrica são DNA dupla fita; RNA; Oligo (DNA fita simples); Proteína e Ion Sphere.

A PEPAB não disponibiliza os kits e reagentes necessários para as quantificações.      

Para saber mais sobre o uso do Qubit 3, clique aqui

Sistema de eletroforese automatizada Bioanalyzer – Agilent

O sistema Agilent 2100 Bioanalyzer é uma solução de eletroforese automatizada baseada em microfluidos estabelecida para o controle de qualidade de amostras de biomoléculas. É adequado para fluxos de trabalho de sequenciamento de próxima geração (NGS), expressão genética, biofarmacêutica e edição de genoma, proporcionando avaliação precisa de amostras como DNA, RNA e proteínas. A PEPAB não disponibiliza os kits e reagentes necessários para as análises.

 

Citômetro de Fluxo FACSCalibur – BD Bioscience

Citômetro de fluxo equipado com 2 lasers e 4 canais para fluorescência. Laser azul (488 nm) = emissão: 515-545 (FL1), 564-606 (FL2) e >670 (FL3). Laser vermelho (635 nm) = emissão: 653-669 (FL4).

Baixe aqui o arquivo para ter acesso aos Procedimentos de Limpeza Após o Uso do Citômetro de Fluxo FACSCalibur.

Baixe aqui o arquivo para ter acesso ao Guia de Operação do Citômetro de Fluxo FACSCalibur.

Citômetro de Fluxo FASCCanto II – BD Bioscience

Citômetro de fluxo equipado com 3 lasers e oito canais para fluorescência. Laser violeta (405 nm) = emissão: 425-475 e 502-535. Laser azul (488 nm) = emissão: 515-545, 564-606, 670-735 e 750-810 Laser vermelho (633 nm) = emissão: 650-670 e 750-810.

Baixe aqui o arquivo para ter acesso ao Guia de Operação do Citômetro de Fluxo FASCCanto II – BD Bioscience

ImageQuant LAS 4000 – GE Heathcare

O ImageQuant LAS 4000 é um sistema de imageamento digital para revelação de membranas de Western Blot através de reações de quimioluminescência.

Baixe aqui o arquivo para ter acesso ao Manual do ImageQuant LAS 4000.

Baixe aqui o arquivo para ter acesso ao Guia de Operação do ImageQuant LAS 4000.

ImageQuant LAS 500 – GE Heathcare

O  ImageQuant LAS 500 é um sistema de imageamento digital de fácil operação equipado com uma câmera com sensibilidade e faixa dinâmica  compatíveis com a detecção de reações de quimioluminescência.

Baixe aqui o arquivo para ter acesso ao Manual do ImageQuant LAS 500.

Leitora de placas Emax Plus – Molecular Devices

O leitor de microplaca EmaxPlus e composto por oito filtros que permitem a mensuração da absorção do comprimento de onda em diferentes regiões do espectro de luz visível, podendo ser aplicado em ensaios de quantificação de proteínas, viabilidade celular e ELISA.

Leitora de placas Victor X2 – Perkin Elmer

O leitor de microplaca VictorX2 e um instrumento para detecção quantitativa de luz emitida seja por fluorescência ou luminescência proveniente de ensaios biológicos.

Microscópio de Microdissecção a LASER – Zeiss PALM MicroBeam

O sistema de microdissecção a LASER é acoplado a um moderno microscópio que permite a obtenção de material celular homogêneo de tecidos ou de preparações citológicas heterogêneas. Grupos de células semelhantes ou mesmo únicas podem ser isoladas e “catapultadas” para microtubos onde serão analisadas. O material obtido pode então ser usado em uma série de técnicas downstream, wertern blotting, técnicas proteômicas entre outras.

Microscópio Confocal a Disco – Zeiss Cell Observer Yokogawa spinning disk

O microscópio confocal a disco giratório permite o estudo de células vivas em tempo real em 3D. Tal técnica permite a visualização e o acompanhamento de processos biológicos complexos e dinâmicos no contexto fisiológico que mais se aproxima do organismo vivo. Também é possível o “imageamento” de espécimes fixados. O sistema está equipado com foco automatizado e CTI de células com controle de temperatura gases e umidade. Esse sistema está equipado 3 linhas de LASER (405, 561 e 647) e com duas câmeras de alta resolução capazes de fotografar em alta velocidade fenômenos biológicos utilizando 2 fluoróforos (cores) simultaneamente.

Microscópio Zeiss Invertido de Fluorescência por Iluminação Estruturada – Zeiss APOTOME

Além de funcionar como um microscópio de fluorescência convencional nesse sistema é possível criar seções ópticas de amostras fluorescentes livre de luz espalhada. Com a iluminação estruturada, é possível observar somente o plano focal da objetiva retirando assim os artefatos que ocorrem comumente na microscopia de fluorescência convencional. É uma maneira simples, mas totalmente confiável de prevenir luz espalhada fora de foco, mesmo em amostras mais espessas. Em muitos casos substitui perfeitamente a microscopia confocal.

Micrótomo Slee CUT 5062

Equipamento utilizado para fazer cortes histológicos em blocos de parafina.

Micrótomo manual leica RM2125RT

Micrótomo manual LEICA RM2125RT: 

Equipamento utilizado para fazer cortes histológicos em blocos de parafina

Capela de Exaustão

Utilizado para derreter parafina e secar lâminas.

Central de inclusão Leica EG 1150 H

Equipamento utilizado para fazer a inclusão do tecido em parafina, formando os blocos de parafina.

Central de inclusão Easy Path, Cygni

Equipamento utilizado para fazer a inclusão do tecido em parafina, formando os blocos de parafina.

Placa fria, Easy Path, Cygni

Utilizado para resfriar os blocos de parafina.

Microscópio

Equipamento utilizado para avaliar a qualidade dos cortes histológicos

Estufa Quimis 316 B14

Equipamento utilizado para promover a aderência dos cortes de parafina às lâminas histológicas

Foto: Polyana Pereira (sequenciamento@biof.ufrj.br), Servidora, IBCCF-UFRJ

Sequenciador automático de DNA 3500 Genetic Analyzer – Thermo Scientific

Sequenciador automático de DNA por eletroforese capilar, com módulo de análise de fragmentos.

Regras de uso: Clique aqui

Foto: Norton Heise (nheise@biof.ufrj.br), Servidor, IBCCF-UFRJ

Sequenciador automático de DNA SeqStudio Thermo Scientific

Sequenciador automático de DNA por eletroforese capilar com módulo de análise de fragmentos 

Regras de uso: Clique aqui

Foto: Norton Heise (nheise@biof.ufrj.br), Servidor, IBCCF-UFRJ

Sequenciador automático de DNA Illumina MiSeq

Sequenciador de DNA de última geração

Regras de uso: clique aqui

Quarentena

Área de Ambientação ou Quarentena para manter os animais recém-chegados ao biotério em racks com microisoladores ventilados.

Racks com microisoladores ventilados localizados na área de quarentena.

autoclave

Área de Lavagem: A lavagem dos materiais é feita nesta sala. O material sujo desce pelo monta carga da sala de lavagem e é esterilizado em um autoclave vertical com 2 portas Ortosíntese, que proporciona esterilização de material oriundos de uma sala não estéril para uma área limpa.

Área de Esterilização: A esterilização dos materiais é realizada neste espaço. Os microisoladores montados e esterilizados sobem pelo monta carga da sala da autoclave para a área de manutenção.

Autoclave vertical com 2 portas, braços Concêntricos e Painel Lateral Ortosíntese

Área de Manutenção: A área de manutenção, localizada no segundo andar, recebe o material estéril pelo monta carga. Nela os animais são manipulados em uma cabine de segurança biológica e mantidos em racks individualmente ventilados.

Montacarga limpo ao lado da cabine de segurança biológica localizados na área de manutenção

Racks com microisoladores ventilados localizados na área de manutenção.

fluxo

Área de Procedimentos: Três salas localizadas no segundo andar destinadas a realização de procedimentos experimentais. Cirurgias, coleta de sangue, inoculação, eutanásia são realizados nestas salas.

Cabine de segurança biológica localizada em uma das salas de procedimentos.